摘要： 为了解我国猪繁殖与呼吸综合征（PRRS）的流行和遗传变异情况，本研究对我国2023 年以来上传至NCBI 数据库中的PRRSV ORF5 基因和全基因组序列进行了生物信息学分析，并通过比对PRRSV 基因序列，对其相似性、系统发育学和基因重组进行探讨。本研究共收集了41 条PRRSV ORF5 基因序列和13 条全基因组序列，13 条PRRSV 全基因序列相似性分析表明：所有序列与NADC30、JXA1、VR2332、QYYZ、NADC34、Lelystad 毒株的相似性分别为43.8%～92.5%、43.4%～84.4%、43.7%～83.3%、42.2%～81.3%、43.3%～95.2%、56.2%～89%。系统发育学分析表明：PRRSV ORF5 基因分群表明，谱系1.8 毒株占比58.5% （24/41），谱系1.5 占比4.8% （2/41），谱系5.1 占比12.2% （5/41），谱系8.7 占比24.39% （10/41）；PRRSV 全基因组分群表明，谱系1.8 毒株占比76.92% （10/13），谱系1.5 占比7.69%（1/13），基因玉型毒株占比15.38% （2/13）。基因重组分析表明：有10 条全基因组序列存在基因重组（10/13），重组的主要亲本毒株为NADC30 （10/10），次要亲本毒株为JXA1 （10/10），此外，NADC34 也参与基因重组（4/10），VR2332 参与了一株PRRSV 重组（1/10）。研究分析结果发现，NADC30-Like 毒株持续占据我国PRRSV 流行的主要毒株，HP-PRRSV 毒株的流行数量仅次于NADC30-Like，NADC34-Like 毒株的流行日益增多。NADC30 是参与基因重组最为活＞的毒株，其次为JXA1 和NADC34，同时，PRRSV 基因玉型毒株在我国呈潜在流行。

关键词: 猪；繁殖与呼吸综合征；PRRSV；ORF5；基因组；序列；系统发育；重组分析

中图分类号:  S828；S852.65